飞鹤卓睿和卓耀作为两款奶粉产品，其主要区别有以下几点：
1. 奶源不同：卓睿采用的是A2奶源，而卓耀采用的是A2奶源。A2奶源中富含A2-β酪蛋白，相较于普通奶粉中的A1-β酪蛋白，A2-β酪蛋白与母乳中的酪蛋白更加接近，更亲和人体。
2. 原料不同：卓睿1段中添加了乳清蛋白粉，而卓耀中没有；卓睿2段以后在生牛乳的基础上添加了脱脂乳粉，卓耀中也没有。
3. 营养方面不同：卓睿各阶段添加的营养素较多，其中添加了6个基础强化配方，包括维生素A、维生素D、维生素E、硒、锌、锰等；而卓耀添加了10个特色强化配方，其中1-2段只添加了OPN骨桥蛋白、OPO结构脂、酪蛋白磷酸肽CPP、叶黄素和水解蛋白五个，3段则额外增添了一个α-乳清蛋白。
综上所述，飞鹤卓睿和卓耀在奶源、原料以及营养配方等方面存在一些差异。在选择奶粉时，应根据宝宝的实际情况和需求来选择合适的产品。
