在高速公路上低于最低时速行驶会被记三分。根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》，在高速公路上行驶的小型载客汽车最高车速不得超过每小时120公里，其他机动车不得超过每小时100公里，摩托车不得超过每小时80公里。如果驾驶人在高速公路上行驶低于规定最低时速，将会被处以20元以上200元以下的罚款。

具体而言，驾驶人有以下交通违法行为之一，一次记3分：

（一）驾驶校车、公路客运汽车、旅游客运汽车、7座以上载客汽车以外的其他载客汽车载人超过核定人数百分之二十以上未达到百分之五十；

（二）驾驶校车、中型以上载客载货汽车、危险物品运输车辆以外的机动车在高速公路、城市快速路以外的道路上行驶超过规定时速百分之二十以上未达到百分之五十；

（三）驾驶机动车在高速公路或者城市快速路上不按规定车道行驶；

（四）驾驶机动车不按规定超车、让行，或者在高速公路、城市快速路以外的道路上逆行；

（五）驾驶机动车遇前方机动车停车排队或者缓慢行驶时，借道超车或者占用对面车道、穿插等候车辆；

（六）驾驶机动车有拨打、接听手持电话等妨碍安全驾驶的行为；

（七）驾驶机动车行经人行横道不按规定减速、停车、避让行人；

（八）驾驶机动车不按规定避让校车；

（九）驾驶载货汽车载物超过最大允许总质量百分之三十以上未达到百分之五十，或者违反规定载客；

（十）驾驶未按规定定期进行安全技术检验的公路客运汽车、旅游客运汽车、危险物品运输车辆上道路行驶；

（十一）驾驶校车上道路行驶前，未对校车车况是否符合安全技术要求进行检查，或者驾驶存在安全隐患的校车上道路行驶；

（十二）连续驾驶载货汽车超过4小时未停车休息或者停车休息时间少于20分钟；

（十三）驾驶机动车在高速公路上行驶低于规定最低时速。

需要注意的是，如果机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，将会被处以警告或者20元以上200元以下的罚款。此外，还需遵守其他相关规定，如高速公路上行驶的小型载客汽车最高车速不得超过每小时120公里，其他机动车不得超过每小时100公里，摩托车不得超过每小时80公里。