应急车道行驶是否扣12分的问题,需要根据具体情况来回答。根据新交规,机动车在城市快速路、高速公路上遇交通拥堵时,在非紧急情况下在应急车道行驶,将会被罚款200元并扣除6分,需要在15天内缴纳罚款。此外,根据相关规定,隧道、桥梁、城市快速路等划设的应急车道,只准许警车、消防车、救护车等车辆执行紧急任务时通行,其他车辆在未发生紧急情况时违法占用应急车道,无论是停下还是行驶中,都属于交通违法行为。如果遇到故障等无法解决的问题,应将车停在紧急停靠带内,开启危险报警闪光灯,并在车后方150米处摆放警告标志,夜间、雨、雾等天气还应当同时开启示廓灯、尾灯和后雾灯。其他人员一定要撤到安全应急车道区域内,并及时拨打高速公路报警电话请求援助。因此,应急车道行驶是否扣12分取决于具体情况,需要遵守相关规定,确保安全通行。