自动启停车不可使用普通电瓶，而需采用专门的自启停电瓶。目前主要有两种自启停电瓶，一种是价格较高的amg电瓶（absorbed glass mat玻璃纤维吸附式蓄电池），它是典型的贫液式电瓶；另一种是efb电瓶（enhanched flooded battery增强型注水式铅酸电池）。

amg电瓶与普通电瓶在隔板与极板设计上存在显著差异。其中，隔板采用多孔玻璃纤维材质，使得电解液可以被吸附在隔板内部。同时，其充电过程中产生的气体会被还原，水分消耗较少，因此可以采用密封阀控式设计，甚至将电池置于驾驶室内。

agm电池采用铅锑合金作为极板材料，并且其厚度远超普通电瓶，这也是agm电瓶能够实现深放电和大电流放电的关键因素。此外，agm电瓶的使用寿命可达到普通铅钙电瓶的3-4倍，但价格相对较高，因此在欧美车型中较为常见。然而，agm电池的一个显著缺点是耐高温性能较差，因此不能放置在发动机舱内。

装有agm电池的车辆必须配备发电机智能管理系统，此系统能够实时监控和检测电瓶的各项数据，并根据实际情况调整充放电策略。由于agm电瓶具有深放电和大电流放电的能力，其充电策略具有很高的灵活性。举例来说，当电瓶电压降至12v左右时，普通铅酸电池启动汽车可能会遇到困难，放电电流也会降低，此时电瓶处于深放电状态，硫化进程会加快。然而，对于agm电池而言，此电压并不会影响其启动电流和电池寿命，因此可以通过调整充电时机来达到节能省油的目的。

与agm电瓶相比，efp电瓶的性能介于普通电瓶与agm电瓶之间，可以理解为加强版电瓶。其价格也相对适中，具有较高的经济性，因此在日系车中应用较多。此外，efp电瓶的耐高温性能优于agm电池，因此可以放置在发动机舱内。