在科目三直线行驶考试中，如果遇到特殊情况是可以停车的。但是，系统会提示直线行驶开始，如果在直线行驶过程中停车，就会导致挂科。因此，在直线行驶之前，一定要确保前方没有障碍物，并且与前车保持100米以上的距离。当系统提示直线行驶结束时，再进行停车等其他动作。

在直线行驶考试中，可能会遇到以下特殊情况：

1. 前方有行人或非机动车。

如果前方道路有行人或非机动车可能会影响到考试，应该适当鸣笛示意。如果对方仍然占据道路，可以采取停车礼让，但不要动方向盘。

2. 与前车距离过近。

如果与前方车辆距离过近，是可以停车的，但不要动方向，应停车等待前车向前开并拉开距离后，再重新起步继续完成考试。

3. 对向来车占道超车。

如果遇到对方有来车，且正占据我方车道准备超越前方的车，应该停车让行，但不得转向方向盘避让，否则直接挂科。

以下是科目三直线行驶考试的技巧：

1. 观察交通情况。

要经常观察内外后视镜，视线不能离开行驶方向超过2秒，时刻观察前后车况，跟车距离，车道路况，时刻准备减速慢行和避让行人。

2. 寻找参照物。

行驶时，注意车身两边到路边变线的距离，可以将分道线作为参照物，让车的左下角对正这条线，发现偏离时及时调整，马路牙子也可以作为参照物。

3. 适时控制车速。

根据交通实际状况，适时控制车速。如遇前车制动，车距过短，路面障碍的时候，要采取减速措施；如遇前车提速，车距过大，路况较好时应主动跟上。

4. 稳住方向盘，适度微调。

不论车速高低都要保持直线行驶，控制车辆在车内道行驶，考生要扶稳方向盘，适当修正行驶路线，尽可能小角度地转动方向盘，眼睛注视前方80-100米处。