从15款车型开始,奥迪Q5采用了第三代EA888发动机,这款发动机解决了第二代车型出现的诸多问题,如烧油等。此外,奥迪A4L、奥迪A4allroadquattro和奥迪A5家族的车型也已经率先更换了第三代EA888发动机。
第三代EA888发动机采用铸铁缸体,缸径82.5mm,缸行程92.8mm。同时,2.0T大功率Gen3B和小功率Gen两个版本经过不断改进,活塞环和旋风油气分离器也得到了改进。官方标称的小功率发动机最大功率为140kw,最大扭矩为320牛米,而大功率发动机的最大功率为165kw,最大扭矩为350牛米。此外,发动机还采用了排气歧管和缸盖一体化设计,这种设计可以利用排气歧管中废气的温度来减少发动机暖机时间,并通过高效的发动机热管理系统减少气缸内的气体,从而提前点火,大大提高了发动机的效率。